Una nueva PCR identifica las variantes británica, sudafricana, brasileña e india del covid

Hasta ahora, los científicos han identificado cinco variantes del SARS-CoV-2 de mayor impacto en la salud pública: alfa, beta, gamma, delta y delta plus (conocidas también como británica, sudafricana, brasileña e india, respectivamente). Saber cómo se han contagiado los pacientes es muy relevante a nivel clínico y epidemiológico, así como de cara al entorno personal o familiar del paciente. Las cinco cepas mencionadas —principalmente la delta y la delta plus— se relacionan con una mayor transmisibilidad, ya que todas ellas incluyen una mutación en la proteína de la espícula (llave de entrada en la célula humana) que aumenta su capacidad de propagación.

“Desde la perspectiva médica, conocer esta información nos permite personalizar la atención clínica. Si se trata de una cepa que se asocia a una mayor gravedad de la enfermedad, podemos intensificar el seguimiento del paciente o establecer un control más riguroso a través de pruebas complementarias de imagen, por ejemplo”, expone la responsable médica de la clínica Ascires Campanar, la doctora Amparo García. “Al principio de la pandemia desconocíamos casi todo sobre el virus. Ahora, su estudio a nivel genómico nos da la posibilidad de anticiparnos y de combatirlo de manera más segura”, defiende la doctora García.

Un nuevo test genético permite ahora identificar esas posibles variantes. Se trata de la nueva PCR Variant de Ascires Sistemas Genómicos, mediante la que se lleva a cabo un genotipado de la muestra positiva por coronavirus. El análisis de la variante se realiza sobre la muestra nasofaríngea o de saliva que ha dado positivo por coronavirus en cualquiera de las pruebas moleculares de Ascires: PCR Multiplex (convencional), PCR Fast (rápida) y PCR Saliva. Sobre esta muestra positiva, se realiza una segunda PCR (PCR Variant) para detectar las mutaciones que han dado origen a las cinco variantes del virus. Este servicio también está disponible en formato kit para que hospitales y centros de salud especializados desarrollen el análisis de genotipado con sus propias muestras.

Además, Ascires Sistemas Genómicos también tiene la capacidad de secuenciar las muestras positivas de SARS-Cov-2 para identificar cualquier otra cepa del virus. De hecho, observar cómo evoluciona el covid en la población y conocer cuáles son las variantes predominantes también es crucial para el propio control de la pandemia. “A nivel epidemiológico, esta información es clave para poder adaptar posibles pautas de seguimiento o de protección”, expone la directora de Ascires Sistemas Genómicos, Mayte Gil.

Clave ante la sospecha de reinfección

La identificación de la variante que ha generado el contagio es también clave en los casos de “sospecha de reinfección o cualquier otro fenómeno de escape a la respuesta inmune”, tal como establece el Ministerio de Sanidad en el protocolo Integración de la Secuenciación Genómica en la Vigilancia del SARS-CoV-2. “En los casos de pacientes que han pasado el covid hace más de 90 días o que ya han sido vacunados y dan positivo en una PCR, sería muy importante la identificación de la variante que ha provocado la nueva infección para ayudarnos a comprender el proceso y el abordaje del mismo”, argumenta la responsable médica de la clínica Ascires Campanar.

Según ha establecido recientemente el Ministerio de Sanidad, todos los contactos estrechos —también aquellos con pauta completa de vacunación o que hayan pasado la infección covid en los seis meses previos— de una persona infectada por las variantes beta, gamma o delta deberán guardar cuarentena. Este cambio de protocolo, recogido en la actualización de la Estrategia de Detección Precoz, Vigilancia y Control de Covid-19 del ministerio, se relaciona con “el mayor riesgo de escape inmunitario” de las variantes sudafricana, brasileña e india. Sin embargo, si se trata de un contagio por variante alfa (británica), los contactos estrechos vacunados con pauta completa o que hayan pasado el covid en los últimos seis meses no están obligados a confinarse.