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Formado en las categorías inferiores del CD Castellón, en 2003/2004 fichó por el juvenil del Valencia. Después de una cesión de un año al Club Deportivo Onda, Pablo Hernández regresó a Mestalla para jugar dos temporadas en el filial, aunque llegó a debutar con el primer equipo en la última jornada de la temporada 2005/2006 ante Osasuna.

Apuesta de presente y futuro, durante la temporada 2006/2007 fue el máximo goleador del Valencia B hasta que en el mercado de invierno fue cedido a las filas del Cádiz.

Pablo Hernández puede jugar en la banda derecha por detrás de los delanteros. Tiene regate y buen lanzamiento a balón parado. En 2007/2008 fue traspasado al Getafe como pago por el fichaje de Alexis Ruano, pero el Valencia se reservó una opción de compra que ejecutó en enero de 2008, aunque Pablo se incorporó a la disciplina ‘che’ en verano de ese mismo año.

En su primera temporada en Primera jugó 21 partidos de Liga y anotó tres goles. Una de las revelaciones de la temporada, en junio de 2009 fue convocado por primera vez con la selección española para disputar la Copa Confederaciones.