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Se formó como profesional en el Estudiantes de La Plata (2000-2004) para pasar después al Tecos de la UAG (2005-2007) y al Atlas mexicano (2007-2008).

El central argentino fichó por el Deportivo en verano de 2008 para sustituir a su compatriota Fabricio Coloccini, pero en su primera temporada jugó solamente 11 partidos, nueve como titular.

Diego Colotto destaca por su contundencia y poderío por alto, además de una notable capacidad de mando y autoridad en el vestuario. Internacional con la selección de Argentina sub-20, ganó el Mundial en 2001.